Le Japon entre la destruction provoquée par le monstre et la course pour le contenir.
Le Japon fait face à une crise nationale sans précédent. Des villes densément peuplées sont confrontées à des évacuations et à des dommages progressifs, tandis que des équipes scientifiques cherchent à comprendre l'origine, les habitudes et les vulnérabilités de Godzilla. Chaque progression du monstre peut transformer la faction d'une cellule en Godzilla, modifiant ainsi la géographie politique et opérationnelle du scénario.
Godzilla émerge dans les eaux proches du Japon et commence à avancer vers l'archipel. Le gouvernement, les Forces d'autodéfense, Monarch et les autorités civiles doivent choisir entre évacuer les villes, étudier le monstre, construire un confinement ou tenter de le détruire avant que de nouvelles cellules ne tombent sous son emprise.
O indicador de destruição aumenta quando Godzilla atinge cidades, instalações ou regiões povoadas. O avanço da contenção aumenta por meio de pesquisa, evacuação, coordenação militar e operações de isolamento. Quando o monstro destruir ou ocupar uma região, sua célula poderá mudar para a facção godzilla. Cidades podem passar de intactas para ameaçadas, evacuadas, danificadas ou destruídas; operações militares devem considerar o risco de ampliar a destruição urbana.